71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1394 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
362 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  97.24 
 
 
362 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  88.22 
 
 
372 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  69.34 
 
 
364 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
386 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  46.54 
 
 
386 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 
419 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 
386 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  39.93 
 
 
418 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
390 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
219 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.34 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  30.3 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
217 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.31 
 
 
236 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
234 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
807 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
219 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
250 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
522 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
218 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 
243 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.59 
 
 
792 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
227 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
217 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
247 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
223 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.02 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  26.48 
 
 
255 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
282 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
889 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
246 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
307 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.25 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.61 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  42.19 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
535 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.61 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
475 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.65 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1497  hypothetical protein  26.82 
 
 
435 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
375 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
346 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
279 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>