32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0742 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 338 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  63.3 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  60.42 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  61.08 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  61.54 
 
 		 1001 aa  359  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  58.95 
 
 		 334 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  63.46 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  63.21 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  70.16 
 
 		 767 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  64.09 
 
 		 380 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  67.31 
 
 		 233 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  66.18 
 
 		 494 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  62.44 
 
 		 225 aa  260  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  51.88 
 
 		 411 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  67.21 
 
 		 221 aa  252  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  52.49 
 
 		 524 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  52.34 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  41.44 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  65 
 
 		 212 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  52.94 
 
 		 212 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  54.55 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  49.78 
 
 		 1160 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  46.7 
 
 		 683 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  42.86 
 
 		 298 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  33.33 
 
 		 274 aa  85.9  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  40.66 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  45.45 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  30.21 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.43 
 
 		 472 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>