101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3463 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 		 691 aa  1411    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  45.7 
 
 		 535 aa  465  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  67.47 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  49.82 
 
 		 1077 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  38.85 
 
 		 631 aa  187  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  41.58 
 
 		 1059 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  41.58 
 
 		 1059 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  42.71 
 
 		 1020 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  41.94 
 
 		 1041 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  40.33 
 
 		 1050 aa  127  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  35.5 
 
 		 1018 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  39.13 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  39.89 
 
 		 1495 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  34.27 
 
 		 1780 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  37.93 
 
 		 1215 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  35.68 
 
 		 1037 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.5 
 
 		 1331 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  31.77 
 
 		 1748 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.02 
 
 		 1146 aa  97.1  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.97 
 
 		 2286 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  34.08 
 
 		 1019 aa  92.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 		 837 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  34.2 
 
 		 388 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  30.85 
 
 		 1160 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  35.15 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1079  peptidase  40.82 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  33.33 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  32.04 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  27.34 
 
 		 638 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  25.42 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  33.33 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  26.94 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  28.57 
 
 		 285 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  27.18 
 
 		 1242 aa  75.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  29.1 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  29.07 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  25.87 
 
 		 375 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  25.68 
 
 		 401 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  34.36 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  34.69 
 
 		 299 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  22.96 
 
 		 1418 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  28.74 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  25.3 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  28.26 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.08 
 
 		 1275 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  25.76 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  29.41 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  27.41 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  28.37 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  26.85 
 
 		 359 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  26.42 
 
 		 1223 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.79 
 
 		 1585 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.79 
 
 		 1474 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5724  putative esterase  28.65 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818383  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.79 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.79 
 
 		 1217 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  25.79 
 
 		 1247 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  24.73 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  24.12 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  24.12 
 
 		 389 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  24.73 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  24.86 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  24.12 
 
 		 398 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  34.96 
 
 		 281 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  24.12 
 
 		 398 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  23.35 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  29.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  29.51 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0954  putative esterase  25.61 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  29.08 
 
 		 276 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  32 
 
 		 327 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  23.78 
 
 		 388 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  32 
 
 		 327 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  33.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  33.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  28.23 
 
 		 245 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  33.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.29 
 
 		 640 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  30.33 
 
 		 317 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  30.33 
 
 		 317 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  26.75 
 
 		 355 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  30.33 
 
 		 307 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  30.33 
 
 		 317 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  28.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  28.74 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  29.51 
 
 		 314 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  29.51 
 
 		 311 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  29.51 
 
 		 314 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  29.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  27.39 
 
 		 244 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  26.06 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  28.46 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  24.65 
 
 		 369 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  32.35 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  37.21 
 
 		 4630 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>