More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0297 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  100 
 
 
342 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  38.52 
 
 
276 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  34.49 
 
 
281 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  35.14 
 
 
290 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  34.49 
 
 
281 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  34.49 
 
 
290 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  34.49 
 
 
281 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  34.49 
 
 
281 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  34.49 
 
 
281 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  34.15 
 
 
291 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  33.12 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  33.7 
 
 
311 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  33.7 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  32.76 
 
 
281 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  33.33 
 
 
314 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  33.33 
 
 
317 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  33.33 
 
 
317 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  33.33 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  33.33 
 
 
307 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  31.85 
 
 
299 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  31.31 
 
 
640 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  28.52 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  32.25 
 
 
708 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  27.05 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  34.66 
 
 
272 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  37.11 
 
 
638 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  34.95 
 
 
560 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  35.93 
 
 
640 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  26.1 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0957  putative esterase  28.38 
 
 
265 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  35.39 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  33.14 
 
 
276 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  34.18 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  32.76 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  33.55 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  37.57 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  35.67 
 
 
285 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  35.36 
 
 
296 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  35.33 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  27.6 
 
 
501 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  28.66 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
837 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  38.01 
 
 
301 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  32.56 
 
 
274 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  32.43 
 
 
490 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  34.38 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  30.29 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  28.57 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  28.57 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  27.41 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  27.35 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  28.57 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  34.87 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  33.16 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  28.09 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1940  esterase  30.12 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000237899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  31.25 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1557  esterase  28.46 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  28.38 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  33.01 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  28.14 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  31.03 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  36.6 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  36.6 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8816  esterase-like protein  28.67 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144603  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  34.38 
 
 
882 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  35.38 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  32.96 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  27.51 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  29.11 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  25.69 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  23.78 
 
 
388 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  31.82 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  30 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2723  putative esterase  28.91 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  29.46 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  30.87 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0720  esterase  27.48 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.276052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  27.56 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2502  putative esterase  33.13 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519739  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  30.41 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3836  putative esterase  31.33 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  34.19 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  34.4 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.81 
 
 
389 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3780  putative esterase  24.22 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  29.88 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  30.81 
 
 
389 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  31.38 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1185  tributyrin esterase  38.84 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  31.38 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1483  esterase  27.8 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  31.38 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  34.23 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  24.82 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  34.23 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  34.67 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1151  esterase  35.54 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000030129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  26.98 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  29.34 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>