62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3395 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3395  putative esterase  100 
 
 
434 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4531  putative esterase  46.56 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4184  putative esterase  40.99 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3573  putative esterase  37.27 
 
 
432 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2602  putative esterase  43.07 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00037083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2110  putative esterase  42.58 
 
 
410 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2335  putative esterase  38.9 
 
 
436 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261928 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1036  hypothetical protein  32.32 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1365  putative esterase  36.09 
 
 
460 aa  186  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3331  putative esterase  32.1 
 
 
436 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0826062  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2999  putative esterase  30.71 
 
 
450 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2984  putative esterase  31.76 
 
 
449 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3028  putative esterase  31.76 
 
 
449 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3545  putative esterase  34.38 
 
 
446 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.290679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11656  hypothetical protein  28.51 
 
 
489 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.46235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  31.71 
 
 
366 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  31.51 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  29.48 
 
 
395 aa  87  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  33.74 
 
 
430 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0626  putative esterase  27.22 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  24.39 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7948  putative esterase  29.58 
 
 
389 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  21.26 
 
 
276 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3364  putative esterase  28.93 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.403252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  27.73 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  22.45 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  26.99 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  26.15 
 
 
291 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  22.45 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  26.99 
 
 
281 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  26.91 
 
 
281 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  26.99 
 
 
281 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  26.99 
 
 
281 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  26.99 
 
 
281 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  26.99 
 
 
290 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  27.75 
 
 
281 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.22 
 
 
708 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  25.73 
 
 
307 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  25.65 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  25.22 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 
837 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  26.28 
 
 
501 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  25 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  25 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  25 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  24.63 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  24 
 
 
267 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  26.26 
 
 
360 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  25.16 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  24.37 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  23.38 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  27.46 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  24.89 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  23.95 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  25 
 
 
296 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  25.71 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  23.95 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  26.13 
 
 
282 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  24.82 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  26.13 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  22.96 
 
 
401 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  24.19 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>