35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1036 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  946    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1365  putative esterase  44.67 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4531  putative esterase  36.26 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2602  putative esterase  32.64 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00037083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3573  putative esterase  29.19 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3395  putative esterase  32.16 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2335  putative esterase  34.64 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2110  putative esterase  29.76 
 
 		 410 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4184  putative esterase  31.79 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3331  putative esterase  25.93 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0826062  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3545  putative esterase  29.08 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.290679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2999  putative esterase  25.29 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3028  putative esterase  27.6 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2984  putative esterase  27.6 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11656  hypothetical protein  27.15 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.46235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  24.55 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7948  putative esterase  26.98 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  26.09 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  25.16 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  26.36 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0626  putative esterase  24.34 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3364  putative esterase  26.92 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.403252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  28.85 
 
 		 360 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  25.69 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  25.68 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  26.9 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  26.14 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  26.14 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  24 
 
 		 296 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  24.71 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  26.9 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  30.43 
 
 		 285 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  24.42 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  29.6 
 
 		 274 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  26.18 
 
 		 401 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>