17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5656 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  100 
 
 
162 aa  331  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  64.49 
 
 
446 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  64.49 
 
 
452 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  64.49 
 
 
452 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
328 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  37.88 
 
 
417 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  36.36 
 
 
417 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  35.9 
 
 
412 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  31.4 
 
 
249 aa  47.8  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  48.84 
 
 
363 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  32.56 
 
 
468 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  46.43 
 
 
325 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  30.85 
 
 
326 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  32.97 
 
 
260 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  32.98 
 
 
343 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  31.25 
 
 
363 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  41.86 
 
 
529 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>