160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0997 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0997  Berberine/berberine domain-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1098    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367258  normal  0.977331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  39.46 
 
 		 529 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  32.02 
 
 		 508 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4988  Berberine/berberine domain protein  32.95 
 
 		 529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332344  hitchhiker  0.00488458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0050  hypothetical protein  32.84 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3377  Berberine/berberine domain protein  32.21 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  31.17 
 
 		 685 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3473  putative oxidoreductase, FAD-binding  29.08 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1646  putative oxidoreductase, FAD-binding  29.08 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3077  putative oxidoreductase, FAD-binding  29.08 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  31.17 
 
 		 685 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  31.17 
 
 		 685 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2895  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.9 
 
 		 553 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0685436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3218  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.32 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3897  FAD/FMN-containing dehydrogenases  29.08 
 
 		 553 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0113  hexose oxidase  29.08 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.258284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.22 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.18 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  26.45 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 466 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.85 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.62 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.35 
 
 		 448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  26.91 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3978  FAD/FMN-containing dehydrogenases  26.48 
 
 		 550 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  27.05 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.65 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  26.8 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  25.97 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  26.05 
 
 		 501 aa  98.2  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25.81 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  26.82 
 
 		 479 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  26.63 
 
 		 461 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  27.68 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.38 
 
 		 465 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  24.65 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  26.19 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  28.31 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  25.41 
 
 		 474 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  26.56 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  25.55 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 614 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 		 864 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 891 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.43 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.98 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.16 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.64 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  26.06 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.95 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 		 896 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 		 982 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.4 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 		 896 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 896 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.33 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.16 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  25.51 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.92 
 
 		 894 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  29.55 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.11 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  31.61 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.34 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.83 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  27.18 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.24 
 
 		 542 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11243  FAD/FMN-containing isoamyl alcohol oxidase MreA (AFU_orthologue; AFUA_6G03620)  25 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.549229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.07 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  27.38 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  26.04 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  38.51 
 
 		 764 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  35.53 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  26.01 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.99 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  23.15 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01787  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.433483  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.84 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  26.41 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>