197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1877 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  43.02 
 
 		 813 aa  645    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  42.6 
 
 		 829 aa  674    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  43.47 
 
 		 845 aa  718    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  44.68 
 
 		 761 aa  718    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  45.75 
 
 		 816 aa  740    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  45.2 
 
 		 798 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  43.17 
 
 		 915 aa  679    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 797 aa  1660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  47.95 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  39.5 
 
 		 927 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  29.73 
 
 		 1207 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.34 
 
 		 1128 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 		 770 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.05 
 
 		 836 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.26 
 
 		 779 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.25 
 
 		 799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  23.41 
 
 		 783 aa  173  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  26.79 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.16 
 
 		 791 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1337  alpha-glucosidase  33.44 
 
 		 303 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.11 
 
 		 839 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  25.09 
 
 		 821 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  28.1 
 
 		 1024 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  24.65 
 
 		 779 aa  157  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.15 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.16 
 
 		 679 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.16 
 
 		 679 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.16 
 
 		 679 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  25.95 
 
 		 679 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  22.91 
 
 		 752 aa  151  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.6 
 
 		 821 aa  150  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.95 
 
 		 679 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  24.4 
 
 		 828 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  25.17 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.86 
 
 		 681 aa  148  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 944 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.61 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  24.91 
 
 		 679 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.17 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  25.39 
 
 		 779 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  24.41 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  23.67 
 
 		 743 aa  143  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.24 
 
 		 760 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  31.42 
 
 		 776 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 765 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  25.69 
 
 		 792 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  23.09 
 
 		 791 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  24.95 
 
 		 765 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  24.45 
 
 		 760 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  24.77 
 
 		 969 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.1 
 
 		 785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  24.1 
 
 		 775 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  25.55 
 
 		 806 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  23.17 
 
 		 757 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 799 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 		 779 aa  137  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.67 
 
 		 772 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  22.69 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  22.58 
 
 		 973 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  22.8 
 
 		 788 aa  137  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  22.69 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  22.91 
 
 		 770 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  24.69 
 
 		 795 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  23.98 
 
 		 777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.52 
 
 		 787 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  23.62 
 
 		 760 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  23.62 
 
 		 766 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  23.75 
 
 		 821 aa  134  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  23.97 
 
 		 804 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  23.94 
 
 		 806 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 784 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  24.5 
 
 		 771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  24.14 
 
 		 840 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  24.04 
 
 		 806 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  22.56 
 
 		 775 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  29.3 
 
 		 797 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 806 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  22.7 
 
 		 788 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  23.94 
 
 		 806 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  24 
 
 		 806 aa  128  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 		 806 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 		 806 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 		 699 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  23.13 
 
 		 803 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  23.52 
 
 		 749 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  23.74 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  24.85 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  23.59 
 
 		 825 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 		 774 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  22.4 
 
 		 790 aa  125  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.08 
 
 		 803 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  22.14 
 
 		 788 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  23.75 
 
 		 951 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  22.57 
 
 		 780 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 778 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  23.47 
 
 		 772 aa  123  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  23.24 
 
 		 780 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  21.93 
 
 		 661 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 995 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>