199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  50.13 
 
 		 761 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  46.07 
 
 		 829 aa  647    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  51.43 
 
 		 798 aa  719    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  100 
 
 		 816 aa  1625    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  46.02 
 
 		 845 aa  653    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  45.09 
 
 		 797 aa  741    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  42.98 
 
 		 915 aa  620  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  48.41 
 
 		 813 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  44.46 
 
 		 739 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 		 927 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  34.79 
 
 		 1128 aa  283  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.87 
 
 		 1207 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26.08 
 
 		 770 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  24.57 
 
 		 783 aa  187  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 		 801 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  28.12 
 
 		 969 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  24.77 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  27.03 
 
 		 821 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.7 
 
 		 1024 aa  172  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.12 
 
 		 791 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  29.21 
 
 		 765 aa  168  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30 
 
 		 779 aa  168  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  22.43 
 
 		 752 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.51 
 
 		 836 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.03 
 
 		 765 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.55 
 
 		 681 aa  163  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  25.21 
 
 		 828 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.16 
 
 		 788 aa  160  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.09 
 
 		 770 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  27.83 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.97 
 
 		 760 aa  158  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.12 
 
 		 785 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28 
 
 		 743 aa  158  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  29.85 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  32.03 
 
 		 695 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 944 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.57 
 
 		 973 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 		 806 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.65 
 
 		 775 aa  152  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  25.35 
 
 		 780 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 795 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  26.92 
 
 		 795 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.54 
 
 		 771 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.59 
 
 		 791 aa  149  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  25.29 
 
 		 951 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.13 
 
 		 836 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  27.02 
 
 		 764 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  29.45 
 
 		 763 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  28.29 
 
 		 760 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  25.05 
 
 		 840 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.73 
 
 		 764 aa  147  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.05 
 
 		 775 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  28.48 
 
 		 679 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  28.48 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  22.83 
 
 		 839 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 695 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 787 aa  145  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  30.35 
 
 		 776 aa  145  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  28.48 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28.32 
 
 		 679 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  28.7 
 
 		 679 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  26.79 
 
 		 712 aa  144  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  23.82 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  23.33 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 799 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.88 
 
 		 788 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  26.83 
 
 		 784 aa  142  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.96 
 
 		 766 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  30.39 
 
 		 821 aa  142  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.78 
 
 		 661 aa  141  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.4 
 
 		 749 aa  141  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  25.05 
 
 		 768 aa  141  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 974 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.81 
 
 		 803 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  27.79 
 
 		 679 aa  140  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  27.8 
 
 		 760 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  26.63 
 
 		 790 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.59 
 
 		 774 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  27.54 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.52 
 
 		 825 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  28.7 
 
 		 777 aa  138  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 		 772 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 995 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  24.2 
 
 		 757 aa  137  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25.23 
 
 		 780 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  23.4 
 
 		 772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.8 
 
 		 806 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.07 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  27.59 
 
 		 806 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.5 
 
 		 777 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.49 
 
 		 775 aa  134  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 806 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  33.78 
 
 		 799 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  26.85 
 
 		 803 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  25.31 
 
 		 772 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 690 aa  132  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.6 
 
 		 803 aa  132  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.12 
 
 		 806 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 813 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  31.44 
 
 		 815 aa  130  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>