196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4758 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  50.23 
 
 
813 aa  654    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  51.95 
 
 
829 aa  676    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  50.13 
 
 
816 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  49 
 
 
845 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 
761 aa  1511    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  61.6 
 
 
798 aa  906    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 
797 aa  736    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  45.86 
 
 
915 aa  617  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  42.34 
 
 
739 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  38.8 
 
 
927 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.87 
 
 
1207 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.04 
 
 
1128 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  25.39 
 
 
770 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.89 
 
 
836 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  30.77 
 
 
765 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  23.54 
 
 
783 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.74 
 
 
681 aa  163  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  28.39 
 
 
775 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  30.02 
 
 
804 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.45 
 
 
764 aa  159  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  29.68 
 
 
695 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  28.02 
 
 
764 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  23.87 
 
 
799 aa  157  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  25.84 
 
 
801 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.11 
 
 
760 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.52 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.14 
 
 
766 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.39 
 
 
765 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 
779 aa  154  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  26.92 
 
 
969 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.59 
 
 
788 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  26.33 
 
 
772 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  27.42 
 
 
760 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  28.05 
 
 
771 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  23.89 
 
 
791 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  25.67 
 
 
839 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.56 
 
 
770 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  23.71 
 
 
779 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
944 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  23.26 
 
 
797 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.14 
 
 
836 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  25.83 
 
 
679 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  25.92 
 
 
679 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  25.83 
 
 
679 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  25.46 
 
 
679 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  25.99 
 
 
760 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.69 
 
 
775 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  24.01 
 
 
951 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  22.22 
 
 
821 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.68 
 
 
779 aa  145  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.46 
 
 
679 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1337  alpha-glucosidase  36 
 
 
303 aa  143  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 
743 aa  143  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.83 
 
 
779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  21.95 
 
 
752 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.65 
 
 
679 aa  140  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  29.03 
 
 
763 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.69 
 
 
757 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  26.21 
 
 
803 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  24.01 
 
 
821 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.03 
 
 
825 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  24.96 
 
 
973 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  25.76 
 
 
828 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.94 
 
 
777 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.38 
 
 
1024 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  25.59 
 
 
774 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  23.9 
 
 
785 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.45 
 
 
775 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.54 
 
 
780 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  23.39 
 
 
792 aa  130  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.42 
 
 
788 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.89 
 
 
791 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.33 
 
 
788 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  25.28 
 
 
772 aa  127  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
799 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  25.8 
 
 
712 aa  126  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  30.07 
 
 
776 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  24.67 
 
 
974 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.87 
 
 
795 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  28.35 
 
 
821 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  25.87 
 
 
772 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  25.87 
 
 
772 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  25.87 
 
 
772 aa  124  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 
695 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  25.87 
 
 
772 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  25.87 
 
 
772 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  25.87 
 
 
772 aa  124  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  25.53 
 
 
772 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.89 
 
 
772 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  22.2 
 
 
746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 
828 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.14 
 
 
806 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  23.23 
 
 
780 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  26.29 
 
 
806 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.14 
 
 
806 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
806 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
806 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  24.32 
 
 
772 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  21.04 
 
 
752 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>