198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1288 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  49.26 
 
 		 829 aa  829    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  100 
 
 		 915 aa  1901    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  58.53 
 
 		 845 aa  1007    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  43.17 
 
 		 797 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  42.35 
 
 		 798 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  47.65 
 
 		 816 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  45.86 
 
 		 761 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  43.8 
 
 		 739 aa  571  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  37.82 
 
 		 813 aa  536  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 927 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.13 
 
 		 1128 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  29.45 
 
 		 1207 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1337  alpha-glucosidase  36.75 
 
 		 303 aa  231  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26.61 
 
 		 770 aa  180  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.09 
 
 		 801 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.48 
 
 		 765 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  26.86 
 
 		 764 aa  153  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.14 
 
 		 760 aa  151  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.45 
 
 		 764 aa  151  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.01 
 
 		 828 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  24.91 
 
 		 743 aa  147  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.75 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  25.36 
 
 		 1024 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  23.76 
 
 		 752 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.5 
 
 		 681 aa  141  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  22.46 
 
 		 836 aa  141  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25.38 
 
 		 797 aa  141  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.19 
 
 		 760 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  26.84 
 
 		 775 aa  140  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.67 
 
 		 779 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  25.89 
 
 		 757 aa  138  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  25.11 
 
 		 794 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 779 aa  137  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.98 
 
 		 836 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 		 771 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  24.85 
 
 		 749 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  25.61 
 
 		 777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  22.87 
 
 		 839 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  24.24 
 
 		 969 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  25.66 
 
 		 712 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  27.42 
 
 		 779 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.32 
 
 		 760 aa  135  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.95 
 
 		 770 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  23.22 
 
 		 791 aa  134  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  23.92 
 
 		 821 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.24 
 
 		 772 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 783 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.99 
 
 		 766 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  26.56 
 
 		 804 aa  132  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 778 aa  131  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  26.55 
 
 		 765 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 		 775 aa  130  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.81 
 
 		 823 aa  128  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  26.26 
 
 		 775 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 779 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  23.81 
 
 		 840 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  21.62 
 
 		 821 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  25.87 
 
 		 803 aa  125  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  25.93 
 
 		 679 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  25.93 
 
 		 679 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.14 
 
 		 679 aa  124  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.14 
 
 		 679 aa  124  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.93 
 
 		 679 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.95 
 
 		 780 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  24.62 
 
 		 690 aa  121  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  24.47 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  24.62 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  24.85 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.32 
 
 		 785 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 944 aa  118  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.31 
 
 		 776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.21 
 
 		 806 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.95 
 
 		 788 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 799 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  26.04 
 
 		 780 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  23.66 
 
 		 772 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  33.33 
 
 		 683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  22.13 
 
 		 752 aa  114  6e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  24.06 
 
 		 687 aa  114  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.11 
 
 		 772 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.06 
 
 		 803 aa  114  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  26.37 
 
 		 763 aa  114  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  23.66 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  23.32 
 
 		 951 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  25.5 
 
 		 828 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  23.66 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.76 
 
 		 795 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  23.66 
 
 		 772 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  23.66 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  23.66 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  24.13 
 
 		 772 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 784 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  24.95 
 
 		 798 aa  112  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  23.61 
 
 		 763 aa  112  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.06 
 
 		 803 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 777 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  22.11 
 
 		 746 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  23.46 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 699 aa  111  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>