49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3362 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 497 aa  1024    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  52.73 
 
 		 666 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.71 
 
 		 648 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.65 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  44.56 
 
 		 472 aa  359  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.74 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  40.08 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 		 488 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.49 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.82 
 
 		 474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.61 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.91 
 
 		 514 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.53 
 
 		 603 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  38.25 
 
 		 634 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  40.04 
 
 		 481 aa  280  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  37.99 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.47 
 
 		 695 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.96 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  35.93 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.72 
 
 		 501 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.53 
 
 		 982 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  31.69 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.77 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  31.39 
 
 		 475 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  30.7 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  30.79 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  31.12 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  29.95 
 
 		 485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.4 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  24.5 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  27.58 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.55 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  26.16 
 
 		 532 aa  113  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  27.31 
 
 		 859 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  25.22 
 
 		 413 aa  90.1  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  25.73 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.73 
 
 		 982 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.09 
 
 		 1217 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  26.67 
 
 		 629 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  34.95 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  24.44 
 
 		 803 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  23.38 
 
 		 630 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  23.19 
 
 		 801 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>