40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3714 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 567 aa  1178    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  32.05 
 
 		 475 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  30.17 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  31.25 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  30.12 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  30.92 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  27.77 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  28.22 
 
 		 859 aa  176  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.29 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  24.54 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.72 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.66 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.46 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.68 
 
 		 648 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  25.13 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  28.4 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.25 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.73 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  25.79 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  26.74 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.88 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  25.84 
 
 		 634 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.62 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.5 
 
 		 497 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  24.86 
 
 		 982 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  24.43 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.26 
 
 		 603 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  23.2 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  27 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.52 
 
 		 695 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  24.61 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  26.91 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.69 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  27.16 
 
 		 726 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.06 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>