30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4557 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  100 
 
 		 494 aa  1023    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  50.29 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  42.53 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  40.12 
 
 		 537 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  35.69 
 
 		 522 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.48 
 
 		 982 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  25.86 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.49 
 
 		 726 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  24.06 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.85 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  23.93 
 
 		 656 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.15 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  23.69 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  22.73 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  42.37 
 
 		 476 aa  53.5  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  21.99 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.8 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.96 
 
 		 1217 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  23.04 
 
 		 648 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  22.71 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  20.96 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  23.8 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  23.27 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  20.83 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.12 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  21.11 
 
 		 1410 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  22.77 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  25.38 
 
 		 681 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>