14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1600 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1036    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  26.62 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  24.84 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  25.93 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  24.47 
 
 		 538 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  23.95 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  24.19 
 
 		 656 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.24 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.8 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  20.92 
 
 		 1410 aa  58.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  22.66 
 
 		 1170 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  29.66 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  22.86 
 
 		 726 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  22.31 
 
 		 688 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>