21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  100 
 
 		 1410 aa  2781    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  44.76 
 
 		 1170 aa  837    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1519  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1513 aa  508  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  42.94 
 
 		 656 aa  492  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.1 
 
 		 982 aa  188  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1278 aa  87.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  24.82 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  48.84 
 
 		 1591 aa  63.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.37 
 
 		 2068 aa  63.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  23.98 
 
 		 522 aa  61.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.87 
 
 		 532 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.91 
 
 		 916 aa  55.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  20.31 
 
 		 538 aa  50.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.97 
 
 		 368 aa  50.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.98 
 
 		 774 aa  49.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25.4 
 
 		 688 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0540  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.6 
 
 		 340 aa  46.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  20.83 
 
 		 1355 aa  46.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  31.08 
 
 		 1729 aa  46.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.6 
 
 		 726 aa  45.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  40.51 
 
 		 2024 aa  45.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>