36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0540 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0540  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 340 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  52.17 
 
 		 1281 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  39.58 
 
 		 898 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  56.72 
 
 		 2353 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.13 
 
 		 846 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  49.47 
 
 		 778 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  56.06 
 
 		 830 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  43.27 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  71.43 
 
 		 1034 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  62.79 
 
 		 253 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02210  hypothetical protein  35.79 
 
 		 680 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.563793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.75 
 
 		 771 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  41.25 
 
 		 430 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  42.53 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  40.86 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.61 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  53.45 
 
 		 875 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  56.06 
 
 		 203 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  41.54 
 
 		 489 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  53.66 
 
 		 1409 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.23 
 
 		 1888 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  38.96 
 
 		 2272 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  53.97 
 
 		 1394 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  45.88 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  60.53 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  59.52 
 
 		 1073 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 201 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.71 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  47.37 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.57 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  41.82 
 
 		 522 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  49.32 
 
 		 625 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  49.18 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  36.21 
 
 		 551 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>