67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  100 
 
 
898 aa  1774    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  58.25 
 
 
808 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  25 
 
 
1194 aa  101  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  26.29 
 
 
521 aa  101  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
560 aa  98.2  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  27.36 
 
 
435 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  28.68 
 
 
440 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  24.09 
 
 
578 aa  91.3  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  27.39 
 
 
460 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  25.36 
 
 
730 aa  91.3  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
532 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
422 aa  88.6  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
465 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  29.68 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  30 
 
 
1139 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0540  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.45 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28 
 
 
774 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
418 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02210  hypothetical protein  43.64 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.563793  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
468 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  23.84 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
701 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  27.49 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  24.11 
 
 
521 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  53.33 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  25.15 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.99 
 
 
1888 aa  68.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
686 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  28.96 
 
 
455 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  22.77 
 
 
593 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
515 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  25.37 
 
 
426 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
1855 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  45.04 
 
 
2179 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  49.56 
 
 
2313 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.1 
 
 
261 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  25.29 
 
 
978 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
680 aa  54.3  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  27.69 
 
 
312 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  42.64 
 
 
2272 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  40.3 
 
 
2449 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  23.49 
 
 
314 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  26.26 
 
 
449 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  28.46 
 
 
1197 aa  52  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  29.37 
 
 
549 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  34.67 
 
 
444 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.79 
 
 
1281 aa  51.2  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  38.66 
 
 
453 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  33.62 
 
 
489 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3876  hypothetical protein  27.88 
 
 
947 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  36.46 
 
 
928 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.99 
 
 
484 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  46.67 
 
 
522 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.91 
 
 
916 aa  48.5  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  34.95 
 
 
1410 aa  47.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.68 
 
 
830 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
257 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.76 
 
 
445 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  40.22 
 
 
433 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  30.27 
 
 
537 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  40.28 
 
 
1880 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  42.86 
 
 
572 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  41.51 
 
 
916 aa  45.8  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  30.23 
 
 
1198 aa  45.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  42.68 
 
 
480 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.73 
 
 
671 aa  44.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>