68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2590 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  100 
 
 
549 aa  1123    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  32.04 
 
 
529 aa  170  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
561 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
577 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  29.93 
 
 
586 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
561 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
515 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 
628 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  30.46 
 
 
561 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  30.75 
 
 
540 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
599 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
562 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.39 
 
 
560 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.39 
 
 
560 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.06 
 
 
560 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.39 
 
 
560 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.06 
 
 
560 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.06 
 
 
560 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.02 
 
 
560 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.86 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  28.26 
 
 
577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  27.51 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  30.68 
 
 
572 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  29.65 
 
 
442 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  33.81 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
680 aa  70.5  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  28.24 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  27.27 
 
 
978 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
1019 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
532 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
808 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  30.81 
 
 
701 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  30.39 
 
 
730 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  27.16 
 
 
1139 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
686 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
445 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
774 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  24.14 
 
 
521 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  32.95 
 
 
447 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  32.95 
 
 
447 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  25.29 
 
 
452 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  29.45 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
578 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  31.79 
 
 
435 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  22.64 
 
 
1194 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
521 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  25.12 
 
 
314 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
440 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  28.24 
 
 
292 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  23.94 
 
 
632 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  22.53 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  29.37 
 
 
898 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  24.86 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
300 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
468 aa  50.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  22.31 
 
 
489 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5306  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  21.82 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  32.19 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 
535 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  23.26 
 
 
509 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>