75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3920 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  77.8 
 
 		 563 aa  881    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  77.54 
 
 		 572 aa  859    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  98.23 
 
 		 561 aa  1108    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  92.91 
 
 		 577 aa  1053    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  90.44 
 
 		 562 aa  1021    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  909    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.28 
 
 		 560 aa  922    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  93.09 
 
 		 561 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  100 
 
 		 599 aa  1233    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.46 
 
 		 560 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  93.09 
 
 		 628 aa  1055    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  76.73 
 
 		 577 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  93.26 
 
 		 561 aa  1050    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  82 
 
 		 560 aa  912    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  41.79 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  39.77 
 
 		 529 aa  319  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  38.55 
 
 		 515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  36.32 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  29.83 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 473 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  27.4 
 
 		 442 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  28.53 
 
 		 429 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 440 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  26.99 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  23.65 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  25.34 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  28.06 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  23.74 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  25.12 
 
 		 468 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1194 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  23.65 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  23.86 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  24.4 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  23.15 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  24.35 
 
 		 1019 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  22.47 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  23.9 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  24.44 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  24.93 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  43.84 
 
 		 808 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5406  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  24.48 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  27.93 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  41.77 
 
 		 251 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  24.83 
 
 		 312 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  24.02 
 
 		 632 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  22.55 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  22.49 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  23.16 
 
 		 512 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1139 aa  51.2  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 499 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  24.3 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  26.82 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  26.9 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 486 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  30.53 
 
 		 275 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  28.1 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  24.48 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  30.63 
 
 		 898 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  24.48 
 
 		 519 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  28.1 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  24.34 
 
 		 447 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1360  hypothetical protein  40.28 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  24.87 
 
 		 643 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  30.34 
 
 		 727 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  27.32 
 
 		 520 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>