79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4384 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  100 
 
 
586 aa  1180    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  63.67 
 
 
515 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  49.39 
 
 
529 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  48.61 
 
 
540 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  40.94 
 
 
577 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
563 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  40 
 
 
572 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.39 
 
 
560 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.58 
 
 
560 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.58 
 
 
560 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.58 
 
 
560 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.39 
 
 
560 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.39 
 
 
560 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.39 
 
 
560 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  38.95 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  39.88 
 
 
561 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.19 
 
 
560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  39.68 
 
 
628 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  39.68 
 
 
561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  38.78 
 
 
562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  39.56 
 
 
599 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  39.36 
 
 
561 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  30.93 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
473 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  33.13 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
560 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
593 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  24.69 
 
 
1194 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  29.2 
 
 
978 aa  92  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  26.95 
 
 
521 aa  90.5  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
532 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
578 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
1019 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  26.63 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  28.61 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
680 aa  80.1  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  27.7 
 
 
730 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
465 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
455 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  26.54 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.08 
 
 
701 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
774 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  26.12 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  25.45 
 
 
898 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.17 
 
 
422 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  25.95 
 
 
394 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  27.63 
 
 
632 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  26.84 
 
 
1139 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  27.27 
 
 
314 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  23.88 
 
 
686 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
808 aa  57.4  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  22.11 
 
 
512 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
300 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  25.53 
 
 
292 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  30.1 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4977  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
396 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  hitchhiker  0.0000000713354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
759 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1604  predicted protein  26.81 
 
 
539 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00477504  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  23.44 
 
 
392 aa  51.2  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  28.46 
 
 
447 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
305 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
486 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5306  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  23.51 
 
 
509 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
643 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  27.07 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_2761  predicted protein  24.39 
 
 
298 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.399041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1360  hypothetical protein  36.17 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  24.57 
 
 
297 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2404  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
406 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>