99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1398 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  100 
 
 
435 aa  911    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  49.4 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  46.85 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  46.47 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  39.22 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  36.74 
 
 
455 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  36.61 
 
 
468 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  37.25 
 
 
422 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  33.83 
 
 
730 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
499 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  33.13 
 
 
560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  30.13 
 
 
521 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
532 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  31.14 
 
 
1194 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  27.25 
 
 
593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  26.48 
 
 
578 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  27.29 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
561 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  27.36 
 
 
898 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
473 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  26.68 
 
 
562 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
577 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
561 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 
628 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
599 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
515 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
701 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
774 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  24.49 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.84 
 
 
560 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  23.91 
 
 
521 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  28.2 
 
 
808 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  28.61 
 
 
586 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
577 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  26.17 
 
 
572 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  28.84 
 
 
978 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.15 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  24.58 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  24.07 
 
 
686 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  25.71 
 
 
759 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  27 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.15 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.15 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.15 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  24.59 
 
 
563 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  23.64 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  37.08 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
632 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  29.33 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  29.07 
 
 
1139 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
717 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  30.19 
 
 
299 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  23.7 
 
 
1855 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  29.63 
 
 
292 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
300 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  32.67 
 
 
549 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
1019 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  30.6 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4284  Alkaline phosphatase  30.77 
 
 
423 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  21.73 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  27.92 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  21.63 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  24.6 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  25.26 
 
 
312 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
284 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  25.13 
 
 
486 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2418  acid phosphatase  29.91 
 
 
325 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2003  acid phosphatase  27.59 
 
 
309 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  21.19 
 
 
429 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0882  hypothetical protein  24.58 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.021625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
275 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09186  Putative acid phosphatase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92200]  24.42 
 
 
616 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02400  putative acid phosphatase  30.3 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4977  metallophosphoesterase  22.11 
 
 
396 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  hitchhiker  0.0000000713354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0073  metallophosphoesterase  20.37 
 
 
619 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  21.53 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1782  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0250  metallophosphoesterase  22.18 
 
 
630 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.663212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  23.86 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  28.17 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1166  metallophosphoesterase  22.18 
 
 
641 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0143203 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1604  predicted protein  23.75 
 
 
539 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00477504  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29551  predicted protein  24 
 
 
194 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1005  metallophosphoesterase  20 
 
 
631 aa  43.5  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000460676  hitchhiker  0.000515762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
307 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  23.86 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5406  metallophosphoesterase  22.74 
 
 
615 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>