76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4384 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  93.58 
 
 
628 aa  1063    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  78.61 
 
 
563 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  913    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.54 
 
 
560 aa  925    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  77.54 
 
 
572 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  93.58 
 
 
561 aa  1061    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  98.23 
 
 
599 aa  1106    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  100 
 
 
561 aa  1155    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  93.4 
 
 
577 aa  1061    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  77.36 
 
 
577 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  90.93 
 
 
562 aa  1028    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  82.08 
 
 
560 aa  911    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  93.76 
 
 
561 aa  1060    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  81.72 
 
 
560 aa  929    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  42.29 
 
 
540 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  38.16 
 
 
529 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
515 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  38.49 
 
 
586 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  30.17 
 
 
549 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  27.68 
 
 
473 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
435 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  26.84 
 
 
442 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  28.53 
 
 
429 aa  90.5  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
440 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  26.99 
 
 
730 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  28.33 
 
 
426 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  23.65 
 
 
593 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  23.74 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  24.17 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  23.37 
 
 
1194 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  24.13 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  23.15 
 
 
680 aa  67  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  24.72 
 
 
978 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
578 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  23.72 
 
 
521 aa  63.9  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
1019 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
774 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  24.93 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5406  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
615 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  24.93 
 
 
460 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  43.84 
 
 
808 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  27.93 
 
 
449 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  23.69 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  24.83 
 
 
312 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  24.02 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  41.77 
 
 
251 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
455 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  23.23 
 
 
686 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  22.16 
 
 
392 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  36.25 
 
 
1139 aa  51.2  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
499 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
300 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  26.9 
 
 
292 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  22.95 
 
 
643 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  37.18 
 
 
255 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  29.87 
 
 
727 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  22.96 
 
 
486 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  24.48 
 
 
489 aa  47.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  30.63 
 
 
898 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  23.13 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
445 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  28.1 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  25.55 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  23.41 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  28.1 
 
 
447 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1360  hypothetical protein  40.28 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  27.32 
 
 
520 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02360  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00800)  25.31 
 
 
497 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>