99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1992 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1082    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  48.03 
 
 
532 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  46.14 
 
 
1194 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  41.21 
 
 
578 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  33.66 
 
 
560 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  30.13 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  31.2 
 
 
593 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  28.73 
 
 
460 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  30.36 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  32.29 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
442 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
465 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
468 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3479  protein of unknown function DUF1533  55.05 
 
 
428 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  57.27 
 
 
425 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  28.15 
 
 
730 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
455 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1987  hypothetical protein  46.22 
 
 
612 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000259198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  31.95 
 
 
680 aa  123  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  26.81 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  27.42 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
418 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6374  metallophosphoesterase  23.45 
 
 
512 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  26.29 
 
 
898 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  26.02 
 
 
489 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
701 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
808 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  29.02 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
540 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
643 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
305 aa  93.6  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  25 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  27.12 
 
 
515 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
586 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
774 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
686 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  28.44 
 
 
978 aa  87.4  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  27.15 
 
 
529 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  26.75 
 
 
447 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
632 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3460  hypothetical protein  26 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.061344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
445 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  26.12 
 
 
521 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  24.94 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
1855 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12331  predicted protein  27.88 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1646  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  30.86 
 
 
1139 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  23.46 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  22.69 
 
 
392 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  23.85 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4482  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
561 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
577 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 
628 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  25.34 
 
 
343 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  29.08 
 
 
1019 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0613  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.9 
 
 
560 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682442  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  27.78 
 
 
312 aa  63.5  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  23.73 
 
 
292 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  26.7 
 
 
299 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4384  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
561 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.559414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  26.04 
 
 
759 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  22.47 
 
 
563 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  22.31 
 
 
599 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_2761  predicted protein  23 
 
 
298 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.399041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
255 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  24.14 
 
 
549 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6550  metallophosphoesterase  22.31 
 
 
572 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4161  metallophosphoesterase  22.1 
 
 
562 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.337466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  28.5 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0259  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.86 
 
 
560 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.86 
 
 
560 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2387  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.86 
 
 
560 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0921  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.81 
 
 
560 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0756  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.81 
 
 
560 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
251 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0744  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.68 
 
 
560 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  26.84 
 
 
313 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
717 aa  53.9  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2690  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.61 
 
 
560 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
284 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4284  Alkaline phosphatase  25 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  22.31 
 
 
300 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  24.09 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
287 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
277 aa  47.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
313 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  27.38 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0882  hypothetical protein  25.12 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.021625  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
278 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
287 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3977  metallophosphoesterase  24.14 
 
 
597 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  28.68 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29551  predicted protein  28.17 
 
 
194 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5228  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
369 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0838269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2418  acid phosphatase  25.56 
 
 
325 aa  43.5  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>