118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1219 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  100 
 
 		 759 aa  1565    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.02 
 
 		 352 aa  144  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 680 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  27.1 
 
 		 394 aa  101  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  26.28 
 
 		 532 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  27.24 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  27.53 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  27 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  26.3 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  26.04 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25.96 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1194 aa  71.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.8 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2425  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.214545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  31.4 
 
 		 343 aa  70.5  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.95 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1792  metallophosphoesterase  26.03 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  26.56 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.52 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  24.4 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  25.7 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0176  metallophosphoesterase  25 
 
 		 392 aa  63.9  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.825563  normal  0.857693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  30.74 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  26.04 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  24.85 
 
 		 442 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  24.85 
 
 		 578 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  20.96 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  27.2 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.81 
 
 		 324 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.61 
 
 		 652 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  24.07 
 
 		 252 aa  56.6  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.36 
 
 		 340 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 322 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 322 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 515 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  21.43 
 
 		 632 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  24.3 
 
 		 299 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  29.7 
 
 		 321 aa  54.3  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.02 
 
 		 630 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3358  metallophosphoesterase  22.59 
 
 		 418 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.44178  normal  0.0362218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3908  hypothetical protein  29.46 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0872501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1139 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.7 
 
 		 323 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5147  metallophosphoesterase  24.02 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.7 
 
 		 323 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  25.32 
 
 		 341 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  23.53 
 
 		 319 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.94 
 
 		 323 aa  51.6  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  26.09 
 
 		 338 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  23.53 
 
 		 346 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  28.22 
 
 		 324 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 586 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  24.37 
 
 		 342 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  27.97 
 
 		 368 aa  51.6  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  23.69 
 
 		 540 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 324 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.43 
 
 		 342 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  29.29 
 
 		 978 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  24.41 
 
 		 331 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  28.35 
 
 		 336 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  25.46 
 
 		 521 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  28.35 
 
 		 336 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  24.57 
 
 		 353 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.22 
 
 		 369 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.97 
 
 		 325 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 344 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  24.57 
 
 		 259 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.79 
 
 		 365 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.66 
 
 		 334 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  24.34 
 
 		 322 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  22.54 
 
 		 577 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  48.5  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  26.79 
 
 		 361 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  27.62 
 
 		 297 aa  48.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  23.31 
 
 		 701 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  21.54 
 
 		 278 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 774 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2351  metallophosphoesterase  30.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.908698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  35 
 
 		 363 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7198  metallophosphoesterase  23.03 
 
 		 563 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  24.03 
 
 		 334 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.82 
 
 		 352 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  23.24 
 
 		 320 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  24.88 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 336 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.73 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.08 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.6 
 
 		 314 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  29.57 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1063 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 1327 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  24.33 
 
 		 577 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>