70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6617 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 341 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  47.55 
 
 		 372 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  37.66 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  37.84 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  37 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  37.82 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  33.23 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.01 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  32.23 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.91 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  29.41 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.98 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.18 
 
 		 897 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.44 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  27 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1044 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1043 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.45 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.74 
 
 		 742 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.6 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  33.53 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1078 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  26.37 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.3 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.61 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  23.6 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.59 
 
 		 1527 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  24.27 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.36 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  24.63 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.57 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  26.57 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.06 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  25.7 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 1060 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1032 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  22.51 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.45 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27990  putative sialidase  27.22 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.126788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  32.65 
 
 		 661 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1075 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 759 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  34.48 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23.5 
 
 		 1084 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  25.71 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.79 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  27.7 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  24.59 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  24.53 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  25 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1054 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1082 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1515  hypothetical protein  24.38 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1147 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.24 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.23 
 
 		 698 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  32.38 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  30.51 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.3 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  33.33 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1090 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 931 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  23.81 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.18 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>