118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2804 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 344 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  45.4 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  44.01 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  44.75 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  44.1 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  44.41 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  44.1 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  44.08 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  45.61 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  45.26 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  45.61 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  44.91 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  40.52 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  39.94 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  39.5 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.06 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  38.11 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  37.62 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.28 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  33.15 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  39.2 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  38.21 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  39.2 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  37.42 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.58 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  37.46 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  35.08 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  34.58 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.88 
 
 		 314 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  31.53 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.37 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  32.65 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.43 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.47 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  31.14 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.79 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.79 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  31.58 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  31.31 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.38 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.89 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.45 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.63 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  29.18 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.91 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  31.56 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  29.47 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.97 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  27.66 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.15 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.15 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.24 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.4 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.79 
 
 		 897 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  27.09 
 
 		 661 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  27.11 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  27.11 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  25.68 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.88 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.31 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  27.63 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  26.49 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.59 
 
 		 698 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  25.18 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.25 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  25.57 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  25.56 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  28.94 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  24.2 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  23.89 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  24.91 
 
 		 614 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  22.83 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.74 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  23.31 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.91 
 
 		 742 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  24.38 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.36 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  24.71 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.49 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  25.09 
 
 		 714 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  23.1 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  21.81 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28.8 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  24.8 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  23.42 
 
 		 1527 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  22.53 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  32.46 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1140 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  22.53 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  20.69 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  32.09 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>