28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  100 
 
 		 352 aa  693    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  38.2 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  33.43 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  28.23 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  31.95 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  31.67 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  37.5 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.84 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  28.1 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.18 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.54 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.92 
 
 		 897 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.74 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0872  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1043 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  25.27 
 
 		 759 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.18 
 
 		 909 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.08 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  27.17 
 
 		 910 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.75 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  26.34 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.68 
 
 		 1041 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.53 
 
 		 661 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  28.09 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  28.09 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 757 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>