96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4188 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  100 
 
 
336 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  100 
 
 
336 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  79.34 
 
 
334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  59.64 
 
 
339 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  59.04 
 
 
337 aa  424  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  57.1 
 
 
340 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  54.68 
 
 
333 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  56.55 
 
 
349 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  45.14 
 
 
333 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  42.3 
 
 
339 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  46.28 
 
 
333 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  42.07 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  41.46 
 
 
338 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  40.06 
 
 
335 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  40.67 
 
 
338 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  40.98 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  40.98 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  43.71 
 
 
363 aa  251  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  37.28 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  41.72 
 
 
408 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  26.39 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  27.11 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.65 
 
 
897 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.46 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.46 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.59 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  30.64 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.76 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.76 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.76 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.14 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.38 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  29.15 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  27.78 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.52 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.11 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  27.03 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  30.61 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.48 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.92 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  31.39 
 
 
363 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  27.03 
 
 
742 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  21.77 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  28.66 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  24.72 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  31.16 
 
 
1120 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.4 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  27.4 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  24.28 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31.82 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  26.1 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.6 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  27.84 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.49 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  30.46 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  30.46 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.83 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  23.85 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  36.76 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  25.3 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  33.33 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  40 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
759 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  32.56 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  28.22 
 
 
368 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  23.84 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.23 
 
 
352 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28.67 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  23.64 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.86 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.09 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  27.22 
 
 
698 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  35.06 
 
 
336 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.81 
 
 
1078 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  31.03 
 
 
338 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  32.56 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.09 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  24.18 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  23.67 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  29.33 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  26.12 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  25 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  24.65 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.43 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.8 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1403  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.37 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.63 
 
 
1021 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.35 
 
 
1075 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.46 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  30.06 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  24.58 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.95 
 
 
1060 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>