17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3908 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3908  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0872501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
578 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
252 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
473 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2768  hypothetical protein  24.5 
 
 
558 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
759 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
532 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  27.53 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1044  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
536 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.315405  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0900  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
536 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0882  hypothetical protein  26.29 
 
 
357 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.021625  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2410  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0101986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2497  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.29641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.7 
 
 
276 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>