76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3229 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.37 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.02 
 
 
371 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.74 
 
 
366 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  30.28 
 
 
336 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  35.91 
 
 
661 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  37.44 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  37.44 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  36.95 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  36.45 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.18 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  34.33 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.15 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.04 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.5 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.75 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  30.7 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  29.64 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  32.8 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  32.26 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  29.52 
 
 
897 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  30.81 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  27.9 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  32.06 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.14 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  28.94 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  26.39 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.55 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  28.02 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.55 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  27.43 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.32 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  27.14 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.64 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.64 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  32.64 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  32.45 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  31.22 
 
 
614 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  28.73 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.73 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.95 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  31.15 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  22.73 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  27.64 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.21 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  27.14 
 
 
353 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  27.37 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  34.38 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  25.7 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  24.19 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  24.81 
 
 
332 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  30.37 
 
 
698 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
759 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  29.03 
 
 
1140 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.29 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  26.01 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.43 
 
 
355 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  31.76 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  28.98 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.79 
 
 
2082 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  23.96 
 
 
742 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  24.2 
 
 
338 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  24.45 
 
 
714 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  28.73 
 
 
931 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.52 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.67 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  26.32 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.78 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  22.8 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.14 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.73 
 
 
608 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  24.58 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  24.58 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  30.25 
 
 
337 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  25.1 
 
 
336 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>