24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12193 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1055    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  32.88 
 
 
658 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0542  metallophosphoesterase  22.86 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  26.02 
 
 
1194 aa  63.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  25.91 
 
 
680 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  23.5 
 
 
515 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
532 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
442 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  23.98 
 
 
643 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  22.9 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  35.62 
 
 
560 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.61 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  24.09 
 
 
521 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
449 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  23.31 
 
 
593 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  28.12 
 
 
2239 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0412  metallophosphoesterase  22.48 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  23.51 
 
 
586 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2590  putative phosphoesterase  23.26 
 
 
549 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671216  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  22.41 
 
 
540 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  21.94 
 
 
468 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>