19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0882 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0882  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  741    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.021625  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  23.42 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0900  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
536 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1044  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
536 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.315405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
578 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2768  hypothetical protein  24.45 
 
 
558 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  23.97 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  25.84 
 
 
532 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  24.44 
 
 
435 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
460 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2833  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
291 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3908  hypothetical protein  26.29 
 
 
368 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0872501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
465 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  25.12 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  22.92 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0692  metallophosphoesterase  23.57 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>