148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2977 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  100 
 
 		 520 aa  1065    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  63 
 
 		 526 aa  700    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  56.87 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  56.92 
 
 		 524 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  54.11 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  55.45 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  50.96 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  51.32 
 
 		 520 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  47.28 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  51.22 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  46.62 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  51.65 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  50.29 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  47.32 
 
 		 527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  48.05 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  48.18 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  47.07 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  49.69 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  50.4 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  50.21 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  50.73 
 
 		 519 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  50.8 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  45.68 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  45.49 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  47.28 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  47.98 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  42.86 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  42.77 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.9 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  41.72 
 
 		 546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  38.48 
 
 		 559 aa  342  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  29.35 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.55 
 
 		 727 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.05 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  28.92 
 
 		 523 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  44.22 
 
 		 191 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  27.68 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  26.63 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  26.28 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.89 
 
 		 522 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  26.16 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  27.29 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.19 
 
 		 573 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  28.29 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.35 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  26.14 
 
 		 519 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.81 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  25.51 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  24.87 
 
 		 538 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 535 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 582 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  25.57 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27 
 
 		 564 aa  100  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  28.05 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.9 
 
 		 585 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.55 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  27.96 
 
 		 555 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  29.44 
 
 		 540 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  28.53 
 
 		 576 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  26.35 
 
 		 538 aa  97.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  26.5 
 
 		 531 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  27.39 
 
 		 522 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  29.3 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  28.46 
 
 		 600 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  24.91 
 
 		 710 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  27.3 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  27.3 
 
 		 617 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  28.04 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.1 
 
 		 511 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.62 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.67 
 
 		 524 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  27.02 
 
 		 541 aa  93.6  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  27.18 
 
 		 588 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  27.66 
 
 		 618 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  27.76 
 
 		 596 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.92 
 
 		 541 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  27.03 
 
 		 550 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  26.93 
 
 		 588 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  27.18 
 
 		 588 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  29.14 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  26.68 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  28.24 
 
 		 531 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  26.93 
 
 		 588 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.45 
 
 		 532 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.19 
 
 		 524 aa  87.4  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  25.71 
 
 		 549 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.31 
 
 		 674 aa  87  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  25.29 
 
 		 558 aa  87  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  25.23 
 
 		 523 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  26.79 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 670 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  27.29 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  26.04 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  25.24 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>