136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1209 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  100 
 
 
600 aa  1211    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  66.72 
 
 
582 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  46.51 
 
 
617 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  46.34 
 
 
606 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  45.45 
 
 
583 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  42.9 
 
 
588 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  42.9 
 
 
588 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  42.74 
 
 
588 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  44.35 
 
 
587 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  41.88 
 
 
589 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  41.65 
 
 
589 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  42.98 
 
 
588 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  42.64 
 
 
588 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  41.94 
 
 
589 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  42.47 
 
 
588 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  42.47 
 
 
588 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  42.67 
 
 
588 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  41.53 
 
 
585 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  42.28 
 
 
576 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  42.6 
 
 
596 aa  422  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  43.31 
 
 
587 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  40.24 
 
 
564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  40.27 
 
 
590 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  41.24 
 
 
589 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  37.9 
 
 
557 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  37.63 
 
 
557 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.12 
 
 
574 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  36.76 
 
 
587 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  32.51 
 
 
674 aa  299  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  34.21 
 
 
566 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33.39 
 
 
555 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  38.01 
 
 
523 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  35.42 
 
 
550 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  35.24 
 
 
540 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  44.44 
 
 
622 aa  250  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  32.59 
 
 
541 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  36.09 
 
 
540 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  34.99 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  31.57 
 
 
516 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  30.51 
 
 
511 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  32.99 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  32.51 
 
 
555 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  37.54 
 
 
538 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  33.27 
 
 
549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  39.15 
 
 
538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.16 
 
 
540 aa  213  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  36.86 
 
 
641 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  36.57 
 
 
531 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  30.43 
 
 
530 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  41.6 
 
 
502 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  30.92 
 
 
523 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  31 
 
 
523 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  31.58 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  32.2 
 
 
529 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  37.31 
 
 
522 aa  200  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.77 
 
 
522 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  36.59 
 
 
531 aa  197  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  35.22 
 
 
521 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 
530 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  31.78 
 
 
529 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.9 
 
 
524 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  30.63 
 
 
563 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  31.09 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  37.34 
 
 
618 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  35.45 
 
 
531 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  30.88 
 
 
528 aa  190  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  30.87 
 
 
679 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  34.1 
 
 
529 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  36.59 
 
 
554 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  31.62 
 
 
534 aa  187  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  29.84 
 
 
534 aa  187  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  32.9 
 
 
515 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  28.7 
 
 
545 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  35.85 
 
 
534 aa  183  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.21 
 
 
552 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  34.23 
 
 
538 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  29.23 
 
 
494 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 
670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  35.24 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  33.52 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  34.09 
 
 
523 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.85 
 
 
523 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  34.93 
 
 
558 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  32.88 
 
 
575 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 
521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 
513 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
525 aa  160  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  31.28 
 
 
529 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  31.17 
 
 
529 aa  151  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  31.73 
 
 
532 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  31.84 
 
 
544 aa  150  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.65 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  26.32 
 
 
791 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
710 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  32.25 
 
 
744 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.91 
 
 
689 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  25.55 
 
 
714 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  31.71 
 
 
450 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  29.55 
 
 
539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>