150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0869 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  62.08 
 
 		 539 aa  695    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  100 
 
 		 539 aa  1109    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  94.81 
 
 		 539 aa  1066    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.25 
 
 		 532 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  51.95 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  50.28 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  52.35 
 
 		 522 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  52.61 
 
 		 520 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  49.11 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  53.67 
 
 		 524 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  50.93 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  50.8 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  51.81 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  49.63 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  49.06 
 
 		 527 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  52.87 
 
 		 520 aa  488  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  48.86 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 523 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.41 
 
 		 518 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  49.3 
 
 		 567 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  49.69 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  45.69 
 
 		 573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  47.01 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  47.64 
 
 		 519 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  45.6 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  47.13 
 
 		 520 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  45.11 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  44.38 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  44.83 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.59 
 
 		 547 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  39.37 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  45.5 
 
 		 191 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  31.37 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  30.69 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.3 
 
 		 727 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.55 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  29.02 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  30 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.56 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  29.27 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.35 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  26.95 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  28.18 
 
 		 587 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  28.8 
 
 		 679 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  29.23 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  30.68 
 
 		 576 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.43 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  27.47 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  29.28 
 
 		 582 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 		 523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  26.64 
 
 		 538 aa  114  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.82 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  26.41 
 
 		 674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.3 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  27.66 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.41 
 
 		 529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  27.79 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 530 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.36 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.85 
 
 		 530 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  29.3 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  28.87 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  28.03 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  28.98 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.83 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.24 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  26.5 
 
 		 538 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.59 
 
 		 573 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  25.57 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  26.45 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  29.66 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  26.94 
 
 		 714 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  28.01 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  30.05 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  29.66 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.43 
 
 		 585 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  28.01 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 550 aa  104  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  28.09 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  28.27 
 
 		 589 aa  104  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 		 670 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27.88 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  27.34 
 
 		 590 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  29.29 
 
 		 618 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  26.61 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  26.54 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  25.49 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  26.94 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.34 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  27.07 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.3 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.79 
 
 		 689 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  29.27 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  29.46 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>