143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1306 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  73.07 
 
 		 483 aa  718    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  100 
 
 		 573 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  59 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  59.8 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  59.58 
 
 		 520 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  55.07 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  57.77 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  52.35 
 
 		 523 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  54.07 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  47.07 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  53.39 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  53.29 
 
 		 520 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  50.49 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  52.57 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.1 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  51.64 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  53.78 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  44.51 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  51.04 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  47.77 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  51.14 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  49.15 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  48.75 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  45.69 
 
 		 539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  45.13 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  45.25 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  48.78 
 
 		 528 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  49.5 
 
 		 546 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  49.7 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  47.85 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  47.93 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.87 
 
 		 555 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  30.12 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  29.05 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  27.68 
 
 		 727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  28.14 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  28.42 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  30.48 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  29.32 
 
 		 523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  27.35 
 
 		 529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  29.4 
 
 		 587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  29.03 
 
 		 550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.77 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.13 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  27.59 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.23 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  40.99 
 
 		 191 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  25.81 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  29.37 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  27.77 
 
 		 563 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  27.89 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.99 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  27.05 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.54 
 
 		 555 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  29.91 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.54 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  27.51 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.12 
 
 		 564 aa  106  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  27.37 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.11 
 
 		 552 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.41 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  27.35 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.22 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  27.64 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.45 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  26.39 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.79 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  26.53 
 
 		 576 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  26.16 
 
 		 674 aa  100  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  27.49 
 
 		 618 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  26.55 
 
 		 531 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 600 aa  97.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  26.97 
 
 		 513 aa  97.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  25.43 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  25.75 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 535 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  27.67 
 
 		 523 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  26.06 
 
 		 529 aa  92.8  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  28.5 
 
 		 558 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  25.53 
 
 		 538 aa  90.9  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.08 
 
 		 524 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  25.12 
 
 		 502 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  26.68 
 
 		 532 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  26.07 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  26.23 
 
 		 523 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.43 
 
 		 529 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  26.72 
 
 		 596 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  24.56 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  26.34 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  25.64 
 
 		 670 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  24.79 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  24.83 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  26.1 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.18 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  23.94 
 
 		 679 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  26.84 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.58 
 
 		 573 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>