144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03245 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  70.9 
 
 		 519 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  66.98 
 
 		 527 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  67.43 
 
 		 527 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  68.4 
 
 		 513 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  70.69 
 
 		 520 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  71.28 
 
 		 517 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  100 
 
 		 523 aa  1058    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  59.3 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  56.24 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  54.39 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  53.74 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  56.82 
 
 		 518 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  55.23 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  52.36 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  56.24 
 
 		 522 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  55.23 
 
 		 524 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  57.56 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  55.6 
 
 		 520 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  55.01 
 
 		 523 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  55.26 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  51.97 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  50.58 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  50.19 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  54.2 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  49 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  50.19 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  49.31 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  46.46 
 
 		 541 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  46.48 
 
 		 559 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  30.4 
 
 		 727 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  44.13 
 
 		 191 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.06 
 
 		 555 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  25.89 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  28.27 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.76 
 
 		 564 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  27.13 
 
 		 529 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  26.77 
 
 		 540 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  25.1 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  26.24 
 
 		 523 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  25.91 
 
 		 534 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.63 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  27.44 
 
 		 588 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.96 
 
 		 573 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  27.18 
 
 		 588 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.21 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  26.77 
 
 		 588 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  26.01 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  26.65 
 
 		 588 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  26.77 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 523 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  28.23 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  27.6 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 588 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.13 
 
 		 552 aa  87  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  26.8 
 
 		 583 aa  87  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  26.91 
 
 		 588 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  28.53 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  28.12 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  24.38 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  28.4 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  27.84 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  27.17 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  26.82 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  25.44 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  28.15 
 
 		 606 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  27.8 
 
 		 588 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  25.1 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  26.35 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  27.73 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.98 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  25.78 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  24.74 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 600 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.29 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  25.77 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  24.89 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  27.39 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  24.26 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.71 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  25.67 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  26.71 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.55 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  24.82 
 
 		 674 aa  77.4  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  25.33 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.08 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  23.76 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  26.16 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  25.97 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>