146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0798 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  63.38 
 
 		 539 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  94.81 
 
 		 539 aa  1066    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  100 
 
 		 539 aa  1110    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  51.57 
 
 		 532 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  52.49 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  52.35 
 
 		 522 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  49.9 
 
 		 526 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  52.52 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  54.29 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  51.74 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  51.4 
 
 		 519 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  52.95 
 
 		 517 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  50.93 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  53.28 
 
 		 520 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  49.81 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  49.07 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  48.5 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.61 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  49 
 
 		 567 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  49.49 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  45.13 
 
 		 573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  48.58 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  47.84 
 
 		 519 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  45.68 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  47.34 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  45.3 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  44.57 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  45.12 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43 
 
 		 547 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  39.55 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  49.38 
 
 		 191 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  29.8 
 
 		 538 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.1 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  26.49 
 
 		 727 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  29.45 
 
 		 531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  29.5 
 
 		 555 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  28.44 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  27.02 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.78 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.93 
 
 		 564 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  29.11 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  29.14 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  27.84 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.35 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 600 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.71 
 
 		 555 aa  113  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  28.61 
 
 		 534 aa  113  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  27.85 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  26.99 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  29.01 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.27 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  27.73 
 
 		 679 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  29.06 
 
 		 549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.85 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  26.82 
 
 		 538 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  28.71 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  26.58 
 
 		 674 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.14 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.15 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  28.03 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  26.55 
 
 		 528 aa  108  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  29.3 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  28.27 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.5 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  27.36 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.9 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  26.19 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.09 
 
 		 573 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  25.55 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.95 
 
 		 585 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  24.73 
 
 		 529 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  29.05 
 
 		 618 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27.47 
 
 		 540 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  28.53 
 
 		 550 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  27.73 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 585 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  28.61 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  29.66 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  29.66 
 
 		 617 aa  101  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  28.74 
 
 		 554 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.39 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  28.61 
 
 		 588 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  26.17 
 
 		 523 aa  100  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  27.97 
 
 		 589 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  28.17 
 
 		 588 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  26.43 
 
 		 557 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  25.75 
 
 		 523 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  25.7 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  29.62 
 
 		 622 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  28.01 
 
 		 588 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 		 588 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 583 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  26.53 
 
 		 544 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>