144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2978 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  62.08 
 
 
539 aa  695    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  100 
 
 
539 aa  1116    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  63.38 
 
 
539 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.31 
 
 
532 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  52.36 
 
 
516 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  49.91 
 
 
526 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  54.02 
 
 
519 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  53.13 
 
 
520 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  53.13 
 
 
517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  49.81 
 
 
527 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
527 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  51.77 
 
 
513 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  49.72 
 
 
524 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  49.34 
 
 
520 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  49.15 
 
 
522 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  48.5 
 
 
528 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  50.19 
 
 
523 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  48.31 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  49.49 
 
 
483 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  47.65 
 
 
518 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  47.81 
 
 
567 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  45.25 
 
 
573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  45.86 
 
 
526 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  45.57 
 
 
514 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  46.11 
 
 
520 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  46 
 
 
519 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  42.38 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  43.21 
 
 
546 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  42.86 
 
 
520 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  42.97 
 
 
547 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  40.41 
 
 
559 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  48.72 
 
 
191 aa  150  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  26.03 
 
 
727 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 
585 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  27.58 
 
 
576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  28.54 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  27.32 
 
 
588 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
588 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.51 
 
 
529 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  29.71 
 
 
606 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  28.35 
 
 
531 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.35 
 
 
573 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  29.47 
 
 
617 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  27.37 
 
 
541 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  28.29 
 
 
588 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.53 
 
 
523 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.67 
 
 
587 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.02 
 
 
573 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  26.67 
 
 
589 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  27.05 
 
 
588 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  27.32 
 
 
554 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.85 
 
 
520 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  27.3 
 
 
588 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.96 
 
 
555 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  27.05 
 
 
588 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  25.97 
 
 
538 aa  101  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  27.25 
 
 
590 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  27.23 
 
 
540 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  27.16 
 
 
589 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
587 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  27.32 
 
 
583 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  25.58 
 
 
522 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  25.37 
 
 
511 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.15 
 
 
523 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 
530 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  26.73 
 
 
545 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  24.81 
 
 
589 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  25.61 
 
 
521 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  26.28 
 
 
600 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
587 aa  95.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.94 
 
 
564 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.89 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  25.35 
 
 
528 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  25.88 
 
 
523 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 
535 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  27.52 
 
 
541 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.53 
 
 
585 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  29.39 
 
 
530 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  26.02 
 
 
618 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  25.36 
 
 
549 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  29.04 
 
 
588 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  25.61 
 
 
450 aa  90.5  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  25.58 
 
 
596 aa  90.5  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  26.8 
 
 
557 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 
531 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  24.94 
 
 
582 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  25.84 
 
 
519 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  27.44 
 
 
550 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  26.3 
 
 
679 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  26.68 
 
 
532 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  26.01 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  29.17 
 
 
513 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  25.42 
 
 
523 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  26.28 
 
 
589 aa  86.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  25.59 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  25.11 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  23.87 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  23.96 
 
 
714 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  27.94 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>