140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3596 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  77.04 
 
 		 588 aa  897    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  71.84 
 
 		 585 aa  886    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  77.21 
 
 		 588 aa  926    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  77.21 
 
 		 588 aa  926    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 587 aa  1204    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  77.21 
 
 		 588 aa  926    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  73.13 
 
 		 589 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  77.17 
 
 		 588 aa  922    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  70.75 
 
 		 590 aa  857    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  76.32 
 
 		 587 aa  873    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  77.34 
 
 		 588 aa  923    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  70.8 
 
 		 589 aa  878    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  71.31 
 
 		 589 aa  865    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  77.17 
 
 		 588 aa  922    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  71.6 
 
 		 589 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  77.17 
 
 		 588 aa  923    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  52.86 
 
 		 576 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 606 aa  569  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 617 aa  568  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  50.71 
 
 		 583 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  47.45 
 
 		 564 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  46.03 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  44.83 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  46.15 
 
 		 596 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  44.35 
 
 		 600 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  42.05 
 
 		 582 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  37.38 
 
 		 622 aa  359  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.78 
 
 		 574 aa  349  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  36.14 
 
 		 587 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.33 
 
 		 555 aa  332  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  35.86 
 
 		 566 aa  330  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  37.88 
 
 		 550 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  35.25 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.22 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  36.01 
 
 		 523 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.8 
 
 		 541 aa  291  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  32.64 
 
 		 541 aa  283  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 		 540 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  32.6 
 
 		 641 aa  259  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  33.46 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  32.47 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  32.7 
 
 		 528 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.11 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  30.98 
 
 		 529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  30.31 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  39.77 
 
 		 516 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  31.45 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.09 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  29.41 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.11 
 
 		 524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  28.49 
 
 		 679 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  29.91 
 
 		 791 aa  220  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  36.46 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 		 530 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  30.09 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  30.13 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  34.38 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  30.44 
 
 		 545 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  35.92 
 
 		 530 aa  213  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  37.97 
 
 		 529 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  31.67 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  32.91 
 
 		 618 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  36.39 
 
 		 531 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  37.08 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  36.86 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  37.43 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  29.7 
 
 		 523 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  34.29 
 
 		 522 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  36.31 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  37.36 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  30.05 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  30.98 
 
 		 554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  35.49 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  30.19 
 
 		 513 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  29.86 
 
 		 563 aa  200  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 		 670 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  35.13 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  27.96 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  29.64 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  32.95 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  35.89 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  28.31 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  35.07 
 
 		 534 aa  187  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  27.83 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  34 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  32.83 
 
 		 524 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  29.76 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  30.18 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  33 
 
 		 544 aa  167  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  30.33 
 
 		 529 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  34.63 
 
 		 710 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  31.48 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  31.46 
 
 		 744 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.88 
 
 		 689 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  29 
 
 		 539 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>