147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  77.03 
 
 
519 aa  786    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  72.5 
 
 
527 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  72.5 
 
 
527 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  71.57 
 
 
513 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1057    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  96.32 
 
 
517 aa  986    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  70.69 
 
 
523 aa  741    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  63.73 
 
 
567 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  56.49 
 
 
528 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  55.91 
 
 
532 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  57.23 
 
 
520 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  55.45 
 
 
516 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  58.02 
 
 
518 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  51.5 
 
 
526 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  55.6 
 
 
522 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  52.93 
 
 
539 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  51.51 
 
 
539 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  52.57 
 
 
523 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  51.32 
 
 
539 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  55.79 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  56.56 
 
 
520 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  52.02 
 
 
524 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  55.85 
 
 
519 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  50.38 
 
 
526 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  51.55 
 
 
514 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  52.34 
 
 
573 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  50.8 
 
 
547 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  49.61 
 
 
546 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  50 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  49.9 
 
 
520 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  45.58 
 
 
559 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  45.45 
 
 
191 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  29.4 
 
 
727 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.15 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.37 
 
 
531 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
588 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
588 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  26.61 
 
 
576 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 
588 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  26.95 
 
 
522 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.35 
 
 
555 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  28.28 
 
 
529 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.83 
 
 
552 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
588 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
588 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  28.21 
 
 
588 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  29.89 
 
 
532 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  28.86 
 
 
523 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.64 
 
 
540 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
588 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.95 
 
 
531 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.91 
 
 
523 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.18 
 
 
530 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 
585 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
535 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  26.59 
 
 
534 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26 
 
 
587 aa  101  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  29.47 
 
 
520 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  26.68 
 
 
511 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  26 
 
 
513 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.03 
 
 
545 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.66 
 
 
674 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
530 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  25.84 
 
 
540 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.2 
 
 
564 aa  97.4  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.02 
 
 
524 aa  97.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.54 
 
 
585 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  25.76 
 
 
529 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  29.21 
 
 
588 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  26.05 
 
 
590 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  28.37 
 
 
563 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  27.49 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  26.61 
 
 
589 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.9 
 
 
538 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 
587 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  26.65 
 
 
531 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  26.12 
 
 
540 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  25.2 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.62 
 
 
573 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  26.55 
 
 
589 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  28.02 
 
 
519 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.25 
 
 
555 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  28.15 
 
 
618 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  26.37 
 
 
538 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  25.81 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  27.69 
 
 
516 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.57 
 
 
573 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  27.38 
 
 
558 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
541 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  28.23 
 
 
596 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  26.91 
 
 
521 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  28.83 
 
 
587 aa  90.1  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  25.27 
 
 
525 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  27.52 
 
 
515 aa  90.1  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.68 
 
 
549 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  25.51 
 
 
589 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  27.64 
 
 
606 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  25.77 
 
 
583 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  26.36 
 
 
529 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  28.14 
 
 
600 aa  87.4  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>