143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4157 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  62.74 
 
 		 520 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  100 
 
 		 526 aa  1088    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  61.12 
 
 		 524 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  59.23 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  58.59 
 
 		 523 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  52.58 
 
 		 520 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  51.26 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  51.74 
 
 		 520 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  50.57 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  51.18 
 
 		 527 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  51.33 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  48.12 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  51.08 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  52.86 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  50.58 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  47.09 
 
 		 526 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  52.78 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  48.85 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  50.31 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  51.44 
 
 		 573 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  48.58 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  47.01 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  49.7 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  47.46 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  45.86 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  50.9 
 
 		 519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  50.4 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  44.34 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  43.29 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  42.86 
 
 		 559 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.8 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  34.32 
 
 		 727 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.96 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  29.21 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  29.91 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  42.18 
 
 		 191 aa  127  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  29.77 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 		 535 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.74 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.29 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.27 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.15 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.84 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.09 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.84 
 
 		 573 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.57 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  27.43 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.37 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  28.79 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  28.01 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  27.46 
 
 		 538 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  26.9 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  26.41 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  26.91 
 
 		 710 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.99 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.62 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  26.07 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  28.3 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.14 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.23 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.85 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  25.88 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  29.52 
 
 		 531 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  27.06 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  29.23 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  28.26 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  28.57 
 
 		 576 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 528 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  29.24 
 
 		 600 aa  97.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  25.74 
 
 		 563 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  26.82 
 
 		 582 aa  96.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  28.09 
 
 		 513 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  24.78 
 
 		 544 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.09 
 
 		 511 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  28.06 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.12 
 
 		 585 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  26.04 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 606 aa  94  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  25.13 
 
 		 679 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 617 aa  93.6  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  26.44 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.19 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  26.72 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  25.76 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.67 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  25.76 
 
 		 525 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 		 670 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  26.38 
 
 		 618 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  28.36 
 
 		 596 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.46 
 
 		 532 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  25.94 
 
 		 588 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  26.12 
 
 		 557 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  26.19 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  23.87 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  26.18 
 
 		 588 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.21 
 
 		 529 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  26.57 
 
 		 589 aa  86.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  27.48 
 
 		 674 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>