146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2184 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  100 
 
 
587 aa  1187    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  55.8 
 
 
555 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  54.63 
 
 
540 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  55.45 
 
 
550 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  49.91 
 
 
540 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  50.57 
 
 
523 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  49.91 
 
 
541 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  49.18 
 
 
541 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  39.84 
 
 
674 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  38.76 
 
 
606 aa  357  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  38.76 
 
 
617 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  38.67 
 
 
583 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  37.99 
 
 
576 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  34.15 
 
 
588 aa  337  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 
585 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.35 
 
 
564 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  33.99 
 
 
589 aa  333  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  34.17 
 
 
590 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  34.58 
 
 
589 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  36.51 
 
 
596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  33.44 
 
 
588 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 
587 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  33.12 
 
 
588 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  33.12 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  32.95 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  33.82 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  33.93 
 
 
589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  34.42 
 
 
589 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  33.01 
 
 
587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  36.76 
 
 
600 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  41.63 
 
 
522 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  37.36 
 
 
511 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.59 
 
 
574 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  34.42 
 
 
557 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  37.38 
 
 
531 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  37.79 
 
 
530 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  37.05 
 
 
538 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  38.33 
 
 
549 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
522 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  35.93 
 
 
529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  36.7 
 
 
582 aa  287  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  39.11 
 
 
555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  34.16 
 
 
557 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  36.49 
 
 
530 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  36.24 
 
 
566 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  38.88 
 
 
540 aa  277  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  36.17 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  40.78 
 
 
523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  36.63 
 
 
524 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  37.41 
 
 
552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  35.23 
 
 
528 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  38.52 
 
 
523 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  34.56 
 
 
523 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  38.12 
 
 
530 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  38.26 
 
 
538 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  33.9 
 
 
523 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  35.65 
 
 
528 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  34.1 
 
 
641 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  37.36 
 
 
502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  35.91 
 
 
531 aa  260  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  36.54 
 
 
534 aa  259  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
554 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  36.14 
 
 
529 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  37.89 
 
 
563 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  35.96 
 
 
534 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  34.67 
 
 
521 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  36.61 
 
 
516 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  32.4 
 
 
538 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  36.75 
 
 
513 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  36.27 
 
 
618 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  35.54 
 
 
558 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  34.5 
 
 
532 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
534 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  34.29 
 
 
523 aa  248  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  45.29 
 
 
622 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  36.67 
 
 
531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  34.84 
 
 
515 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
494 aa  236  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  31.54 
 
 
575 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  35.03 
 
 
520 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  34.41 
 
 
545 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  33.82 
 
 
544 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  31.61 
 
 
519 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
535 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  32.99 
 
 
525 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.09 
 
 
524 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  31.16 
 
 
529 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  31.61 
 
 
521 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  34.27 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  26.98 
 
 
679 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
710 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  29.34 
 
 
450 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 
670 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  26.43 
 
 
714 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  31.2 
 
 
744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  28.18 
 
 
791 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.95 
 
 
689 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.05 
 
 
585 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>