152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3867 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  91.54 
 
 
520 aa  911    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  100 
 
 
519 aa  1037    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  67.23 
 
 
518 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  62.08 
 
 
483 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  58.42 
 
 
520 aa  541  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  57.79 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  57.8 
 
 
514 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  55.85 
 
 
520 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  53.48 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  54.51 
 
 
523 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  55.03 
 
 
517 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  50.75 
 
 
527 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  53.59 
 
 
513 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  48.28 
 
 
532 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  53.8 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  50.75 
 
 
527 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  53.8 
 
 
519 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  52.16 
 
 
522 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  47.22 
 
 
526 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  52.77 
 
 
524 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  49.53 
 
 
528 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  53.93 
 
 
547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  50.88 
 
 
567 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  50.55 
 
 
546 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  50.94 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  49.9 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  46.42 
 
 
539 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  45.95 
 
 
539 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  48.18 
 
 
559 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  49.52 
 
 
520 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  44.72 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  26.73 
 
 
727 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  48.32 
 
 
191 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  27.81 
 
 
528 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.87 
 
 
564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  29.57 
 
 
540 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  29.41 
 
 
541 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  30.07 
 
 
523 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  31.29 
 
 
520 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  30.28 
 
 
540 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  28.91 
 
 
541 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  27.95 
 
 
521 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  30.08 
 
 
531 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  28.15 
 
 
538 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29 
 
 
555 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  26.85 
 
 
600 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  30.79 
 
 
538 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  26.9 
 
 
576 aa  97.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  27.19 
 
 
531 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.11 
 
 
573 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  29.24 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  27.85 
 
 
587 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  27.47 
 
 
523 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.63 
 
 
549 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.65 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.38 
 
 
573 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.15 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  26.95 
 
 
582 aa  91.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  29.64 
 
 
558 aa  90.5  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  26.43 
 
 
674 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.67 
 
 
524 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  30.75 
 
 
523 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  26.62 
 
 
583 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  28.79 
 
 
519 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  27.79 
 
 
530 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
530 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.86 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  28.37 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  26.94 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  26.48 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.83 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.82 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  26.88 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  26.36 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  26.51 
 
 
511 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  27.33 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  25.72 
 
 
590 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  25.39 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  27.31 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  26.7 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  25.71 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.69 
 
 
585 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  25.71 
 
 
606 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  26.15 
 
 
589 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  26.91 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  27.01 
 
 
529 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  27.18 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 
588 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  27 
 
 
588 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 
670 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.32 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.4 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  28.28 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  27.91 
 
 
550 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  27.25 
 
 
588 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  26.69 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>