102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1400 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  100 
 
 		 458 aa  936    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.99 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  31.75 
 
 		 637 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  33.98 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.41 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  29.57 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  26.71 
 
 		 370 aa  96.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 532 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  32.45 
 
 		 727 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  24.82 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  27.02 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  25.69 
 
 		 528 aa  79.7  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  25.38 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  23.81 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  30.23 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  24.15 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  29.05 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  24.33 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  24.83 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  26.67 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  25.7 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  24.71 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  25.28 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  25.99 
 
 		 529 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  25.25 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  25.71 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.29 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.37 
 
 		 538 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  24.54 
 
 		 541 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  23.77 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  27.29 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  24.56 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  24.87 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  24.43 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.76 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  27.17 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  24.19 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  24.46 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.02 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1948  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  26.94 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  23.16 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2305  hypothetical protein  37.25 
 
 		 131 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.91 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  23.91 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  24.07 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  24.36 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  24.05 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  25 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  25.23 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  25.9 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  22.81 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  23.99 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  23.03 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  22.41 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.94 
 
 		 469 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  25.95 
 
 		 618 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  24.09 
 
 		 534 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  25.51 
 
 		 528 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  23.72 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  25.3 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.11 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  28.99 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  23.53 
 
 		 529 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  31.82 
 
 		 530 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  23.94 
 
 		 563 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  27.16 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.64 
 
 		 555 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  26.01 
 
 		 540 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  23.75 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  27.9 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.8 
 
 		 523 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.8 
 
 		 1298 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  25.08 
 
 		 519 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  24.83 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  24.29 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  24.29 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.2 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  23.54 
 
 		 528 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  24.34 
 
 		 529 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  22.22 
 
 		 530 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  29.66 
 
 		 540 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  24.32 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  24.61 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  24.36 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  25.76 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  30.25 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  25.7 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  28.1 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.04 
 
 		 587 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  24.56 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.63 
 
 		 702 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  23.8 
 
 		 545 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  22.9 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  25 
 
 		 550 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.21 
 
 		 527 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>