68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4422 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  766    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  51.29 
 
 
370 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  44.22 
 
 
340 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  30.7 
 
 
507 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  25.58 
 
 
433 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  26.96 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.18 
 
 
637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.57 
 
 
458 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  27.86 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  25.38 
 
 
530 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.83 
 
 
471 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.97 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  23.01 
 
 
473 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  23.16 
 
 
523 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  22.97 
 
 
534 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  23.76 
 
 
523 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  23.53 
 
 
538 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  23.57 
 
 
534 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  23.21 
 
 
534 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  24.72 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  20.77 
 
 
450 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  22.22 
 
 
460 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  22.51 
 
 
489 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  21.43 
 
 
727 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  22.51 
 
 
489 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  21.17 
 
 
558 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  22.79 
 
 
511 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  22.65 
 
 
532 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  22.91 
 
 
513 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  21.12 
 
 
585 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  24.55 
 
 
530 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.1 
 
 
475 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  23.53 
 
 
529 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  20.33 
 
 
520 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  24.73 
 
 
531 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.58 
 
 
1298 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  23.32 
 
 
674 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  20.49 
 
 
549 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  22.95 
 
 
532 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  22.79 
 
 
520 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  20.54 
 
 
545 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  22.36 
 
 
523 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.55 
 
 
518 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  23.75 
 
 
554 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  22.07 
 
 
523 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  22.84 
 
 
522 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.11 
 
 
555 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  22.41 
 
 
520 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  22.45 
 
 
555 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  19.87 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  23.18 
 
 
522 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  22.14 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  22.19 
 
 
516 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  22.51 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  19.52 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  24.26 
 
 
539 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  22.83 
 
 
618 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  22.86 
 
 
583 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  22.53 
 
 
557 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  21.94 
 
 
529 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  21.37 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  25.61 
 
 
617 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  25.61 
 
 
606 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  22.18 
 
 
544 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  21.6 
 
 
523 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.62 
 
 
547 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  21.16 
 
 
525 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 
530 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>