62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3408 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  768    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  51.29 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  39.61 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  29.5 
 
 		 507 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  25.63 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  25.53 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  29.41 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.35 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  25.83 
 
 		 530 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.71 
 
 		 458 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.3 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  24.79 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.39 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  28.14 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.21 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  25.51 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  23.4 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  27.41 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  22.39 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  23.79 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4485  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.04 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133159  normal  0.0285057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  22.73 
 
 		 494 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 		 530 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  22.53 
 
 		 529 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  24.79 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  21.33 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  22.12 
 
 		 585 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  23.45 
 
 		 531 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.08 
 
 		 1298 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.57 
 
 		 552 aa  52.8  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  23.4 
 
 		 558 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  21.95 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  23.41 
 
 		 520 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  22.74 
 
 		 534 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  23.23 
 
 		 522 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.03 
 
 		 540 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  21.56 
 
 		 564 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  21.85 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  24.15 
 
 		 521 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  23.75 
 
 		 529 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  20.51 
 
 		 674 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  21.32 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  23.47 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  22.65 
 
 		 545 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  24.74 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  21.48 
 
 		 522 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  23.55 
 
 		 539 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  20.4 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  22.38 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  23.84 
 
 		 523 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  24.4 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  21.22 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  20.89 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  20.32 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  26.36 
 
 		 589 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.73 
 
 		 524 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  20.06 
 
 		 535 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.22 
 
 		 518 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  20.47 
 
 		 617 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  21.71 
 
 		 519 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  20.47 
 
 		 606 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  22.52 
 
 		 531 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>