95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2702 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  100 
 
 		 460 aa  966    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  40.33 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  40.33 
 
 		 489 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  37.61 
 
 		 469 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  35.06 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.93 
 
 		 702 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  30.59 
 
 		 619 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 558 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  24.21 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  24.21 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  24.21 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.44 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  21.54 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  24.53 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  27.97 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  22.36 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  26.27 
 
 		 540 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  27.75 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  27.71 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  23.42 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  25.29 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  26.42 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  26.42 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  25 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.3 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  22.56 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  23.91 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  22.15 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  26.15 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  25.62 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.2 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  25.36 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  24.07 
 
 		 524 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  24.62 
 
 		 520 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  26.81 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  24.14 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.48 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  27.37 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  24.62 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  23.92 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.23 
 
 		 552 aa  54.7  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.11 
 
 		 527 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  23.41 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.35 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  23.31 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  26.07 
 
 		 546 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25 
 
 		 727 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  26.09 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  24.35 
 
 		 525 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  25.45 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  23.63 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  25.38 
 
 		 539 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  23.3 
 
 		 523 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  22.17 
 
 		 520 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  23.29 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 		 516 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  24.62 
 
 		 539 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  21.91 
 
 		 540 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  23.42 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  25.09 
 
 		 528 aa  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  22.54 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  24.78 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  25.11 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  22.35 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  19.86 
 
 		 585 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  24.9 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.81 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  22.81 
 
 		 538 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  22.76 
 
 		 567 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  21.35 
 
 		 494 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  23.75 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.7 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  23.87 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  25 
 
 		 621 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  26.09 
 
 		 548 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  26.12 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  21.35 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  23.73 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.33 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.71 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  22.69 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  23.21 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  23.58 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  23.26 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  24.47 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  23.86 
 
 		 521 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  25 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  21.83 
 
 		 540 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  22.95 
 
 		 450 aa  43.5  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  23.2 
 
 		 523 aa  43.5  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  23.17 
 
 		 520 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>